• Tuesday July 16,2019

XMRV - nevinný na všetkých počte?

Anonim

Bomba sa práve odohrávala v pokračujúcej diskusii o XMRV, vírusu, ktorý môže alebo nemusí spôsobovať syndróm chronickej únavy. Vlastne 4 bomby.

Súbor dokumentov, ktoré sa dnes nachádzajú v Retrovirologii (1, 2, 3, 4), tvrdí, že mnohé predchádzajúce štúdie, ktoré tvrdia, že našli vírus, v skutočnosti nerozpoznali XMRV.

Tu je rub. XMRV je retrovírus, trieda chýb, ktorá zahŕňa HIV. Retrovírusy sú zložené z RNA, ale môžu sa vložiť do genetického materiálu hostiteľských buniek ako DNA. Takto sa rozmnožujú: akonáhle ich DNA je súčasťou chromozómov hostiteľskej bunky, táto bunka sa končí vytvorením viacerých kópií vírusu.

Existuje však veľa retrovírusov a ešte existujú iné, ktoré sú teraz vyhynuté. Takže bity retrovírusovej DNA sú rozptýlené v celom genóme zvierat. Tieto sa nazývajú endogénne retrovírusy (ERV).

XMRV je veľmi podobná niektorým ERV, ktoré sa nachádzajú v DNA myší. A myši sú najobľúbenejšie laboratórne cicavce na svete. Takže môžete vidieť potenciálny problém: laboratóriá na celom svete sú plné myší, ale myšia DNA sa môže objaviť ako DNA "XMRV" na PCR testoch.

Ochranní virológovia bránia tomu, aby skontrolovali konkrétne myšiu DNA. Ale väčšina myších kontaminovaných testov je zameraná na myšaciu mitochondriálnu DNA (mtDNA). Teoreticky je test na myšiu mtDNA všetko, čo potrebujete, pretože mtDNA sa nachádza vo všetkých bunkách myší. Teoreticky.

Teraz štyri články (alebo sú to štyri jazdci?) Argumentujú v skratke, že myšia DNA sa uvádza vo väčšine populárnych testov, ktoré sa v minulosti používali ako "XMRV", že myšia kontaminácia je veľmi častá - dokonca niektoré testovacie súpravy sú ovplyvnené! - a že testy na myšiu mtDNA nie sú dostatočne dobré na zistenie problému.

  • Hue a kol. Hovoria, že "Taqman PCR primery opísané skôr ako XMRV-špecifické môžu amplifikovať bežné myšie ERV sekvencie z myši, čo naznačuje, že myšia DNA môže kontaminovať vzorky pacientov a zameniť špecifickú XMRV detekciu." infikovaných XMRV, sú skutočne infikované hybridom XMRV a myšou ERV, o ktorých vieme, že nemôžu infikovať ľudí.
  • Sato a spol. Uvádzajú, že testovacie súpravy PCR od firmy Invitrogen, vedúcej biotechnologickej spoločnosti, sú kontaminované myšacími génmi vrátane ERV, ktoré sú takmer identické s XMRV, a že to sa ukazuje ako falošne pozitívne použitím bežne používaných PCR primérov "špecifických pre XMRV".
  • Oakes a kol. Hovoria, že u 112 CFS pacientov a 36 zdravých kontrol, v niektorých vzorkách detegovali "XMRV", ale všetky tieto vzorky boli pravdepodobne kontaminované myšacou DNA, pretože "všetky vzorky, ktoré boli pozitívne testované na XMRV a / alebo MLV DNA, pre vysoko abundantnú IAP dlhú terminálnu repetíciu [nájdené iba u myší] a väčšina bola pozitívna na myšie mitochondriálne sekvencie cytochrómovej oxidázy [nájdené len u myší] "
  • Robinson a kol. Súhlasia s Oakesom a ďalšími: v niektorých ľudských vzorkách, v tomto prípade bunkách rakoviny prostaty, našli "XMRV", ale zistili, že všetky "infikované" vzorky boli kontaminované myšou DNA. Odporúčajú, aby sa v budúcnosti vzorky testovali na myšie gény, ako je napríklad dlhá terminálna replikácia IAP alebo cytochróm oxidáza a výskumníci by sa nemali spoliehať na testy myšej mtDNA.

Všetci majú otvorený prístup, aby si všetci mohli pozrieť. Pre ďalší prehľad pozri tento súhrn uverejnený spolu s nimi v Retrovirology.

Chýbajú technické znalosti na posúdenie týchto tvrdení, bezpochyby sa veľa ľudí bude ponáhľať robiť to skoro. (Aktualizácia: Výborný virologyblog má technickejšiu diskusiu o týchto štúdiách.) Ale je tu niekoľko vecí, ktoré je potrebné mať na pamäti.

Po prvé, tieto dokumenty spochybňujú testy pomocou PCR na detekciu XMRV DNA. Avšak nemajú čo povedať o štúdiách, ktoré hľadali protilátky proti XMRV v ľudskej krvi, prinajmenšom nie priamo. Nie je to veľa z nich, ale dokument, ktorý začal celý príbeh, Lombardi et al (2009), hľadal a našiel anti-XMRV imunitu a tiež použil rôzne iné metódy na podporu myšlienky, že XMRV je prítomný u ľudí. Takže to nie je "okamžitý knock-out" teórie XMRV, hoci to určite je vážna rana.

Po druhé, ak je pravdivá myšia teória, má vážne dôsledky pre myšlienku, že XMRV spôsobuje syndróm chronickej únavy a tiež staršiu myšlienku, že je spojená s rakovinou prostaty. Zostáva však tajomstvo: prečo boli vzorky CFS alebo pacientov s rakovinou prostaty pravdepodobnejšie kontaminované DNA myši ako vzorky zo zdravých kontrol?

Robert A Smith (2010). Kontaminácia klinických vzoriek s nukleovými kyselinami kódujúcimi MLV: dôsledky pre XMRV a iné kandidátne ľudské retrovírusy Retrovirologia: 10.1186 / 1742-4690-7-112


Zaujímavé Články

Osamelý ROSAT zachytený vo videu

Osamelý ROSAT zachytený vo videu

V skutočnosti som trochu neočakával, že sa to stane: fantastický "amatérsky" astronóm Thierry Legault bol schopný pozorovať a získať video astronomického satelitu ROSAT, pretože jeho záverečné obežná dráhy okolo Zeme: Pozoroval to aj 16. októbra, ale myslím, že video z konca septembra to ukazuje lepšie. Aby som vám ukázal, a

Tricky Had Hacks Jeho korisť  's nervový systém chytiť jedlo

Tricky Had Hacks Jeho korisť 's nervový systém chytiť jedlo

Mnohé zvieratá závisia od tajnosti, aby chytili korisť, ale malý chápaný vodný had sa uchvátil k jednoznačným podvodom. To je to, čo vedec Vanderbilt University našiel, keď analyzoval spôsob, ako had zachytáva ryby, podľa štúdie publikovanej v zborníku Národnej akadémie vied . Had, ktorý je pôvodom v juhovýchodnej Ázii, využíva dobre známy reflex, ktorý ryby vlastnia. Mechanizmus sa vyskytuje vte

Balistické penisy a vývrtky vagíny - sexuálne bitky kačiek

Balistické penisy a vývrtky vagíny - sexuálne bitky kačiek

Patricia Brennanová z Yale University sa snaží povzbudiť mužské pižmové kačice, aby spustili svoje balistické penisy do skúmaviek. Kačica zvyčajne drží penis vo vnútri vrecka vo svojom tele. Keď dorazí čas na párenie, penis exploduje smerom von do úplne vztyčeného 20 cm, okolo štvrtiny celkovej dĺžky tela. Celý proces trvá len tre

Hlasujte za rok 2016 Pliny pre sopečnú udalosť roka

Hlasujte za rok 2016 Pliny pre sopečnú udalosť roka

2016 sa blíži, takže viete, že je čas pozrieť sa na sopečný čin roka. Vezmite si chvíľku a hlasujte za svoje prvé 3 sopky, o ktorých si myslíte, že si zaslúžia česť Vulkanickej udalosti roka - prestížnej ceny Pliny . Ak potrebujete nejaké osviežovače, prečítajte si prehľad o niektorých chladných erupciách v Atlantiku , prehliadajte týždenné správy o vulkanických aktivitách programu Global Volcanism Program alebo sa vráťte späť na príspevky tu o výpadkoch . Výsledky prieskumov budú otvorené do 5.

Ako vytvoriť počítač vo vnútri zosnulého bobra

Ako vytvoriť počítač vo vnútri zosnulého bobra

Nakoniec, spôsob, ako spojiť našu lásku s taxidermie s láskou k technológii. Z Kottke.org: Obávajúc sa, že prírodný svet sa nahrádza technológiou, umelkyňa [Kasey McMahonová] nainštalovala pracovný počítač do nečinného bobra. Najprv vytvorila počítač z dosky, otestovala ju, potom vybrala vypchatý bobor a vyformovala obidva spolu pomocou spandexového spreja, živice a sklenených vlákien. Po troch mesiacoch práce bol

Obrie chobotnice, aké veľké oči máte.  Ešte lepšie na pozorovanie spermie s veľrybami.

Obrie chobotnice, aké veľké oči máte. Ešte lepšie na pozorovanie spermie s veľrybami.

Obrie chobotnice vidí svet očami veľkosti futbalových loptičiek. Sú najmenej 25 centimetrov (10 palcov) naprieč a robia z nich najväčšie oči na planéte. Pre porovnanie najväčšie rybie oko je 9-centimetrová guľa mečiara. To by zapadalo do žiaka obrie chobotnice! Dokonca aj modrá veľryba - najväčšie zviera , ktoré kedy existovalo - má ošumělé oči o veľkosti 11 centimetrov. Tak prečo veľký skok vo veľko